Тут зустрічаються такі типи і підтипи грунтів: Сіро-бурі Такири Лугово-бурі напівпустельні Лугові напівпустельні пустельні
Ґрунти пустель дуже своєрідні: на півночі та центральних районах — червоні, червоно-бурі та бурі ґрунти, на півдні – сероземоподібні ґрунти, на заході – пустельні ґрунти, а для Великої Піщаної пустелі і Великий пустелі Вікторія характерні червоні піщані пустельні ґрунти, біля озера Ейр – солончаки та солонці.
У Південній Африці розташовані внутрішньоконтинентальна тропічна пустеля Калахарі та прибережна пустеля Наміб.