ЯКИХ ТВАРИН І ПТАХ МОЖНА ПОБАЧИТИ В Заповіднику У Байкальському заповіднику 376 видів хребетних тварин, у тому числі понад 50 видів – ссавці, близько 293 видів – птиці. Фауна безхребетних тварин налічує понад 1700 видів, іхтіофауна представлена 17 різними видами риб.
Найбільш звичайними видами широколистяних лісів, що гніздяться. заповідника є: велика синиця, блакитна, дубонос, піночка-тріскачка. У поясі буковопіхтових лісів мешкають жовтобрюха піначка, московка, лісова завирушка, сніговик, жовтоголовий королек, чорноголовий поповзень, кропив'янка.
У заповіднику зростає понад 1150 видів вищих судинних рослин (за даними на 2021 р.), лісами зайнято близько 70% території. Багато з них рідкісні, ендемічні та реліктові види. До Червоної книги Бурятії (2013) занесено 49 видів та 14 — до Червоної книги РФ.