Гепарин натрію збільшує нирковий кровотік, підвищує опір судин мозку, зменшує активність мозковий гіалуронідази, знижує активність сурфактанту в легенях, пригнічує надмірний синтез альдостерону в корі надниркових залоз, пов'язує адреналін, модулює реакцію яєчників на гормональні стимули, посилює…
Фармакодинаміка Гепарин, що вводиться в людський організм, діє так само, як і ендогенний: активує антитромбін III та ліпопротеїнліпазу.
Гепарин натрію знижує в'язкість крові, зменшує проникність судин, стимульовану брадикініном, гістаміном та іншими ендогенними факторами, і перешкоджає таким чином розвитку стазу.
Механізм дії гепарину заснований насамперед на його зв'язуванні з антитромбіном III, який є природним інгібітором активованих факторів зсідання крові: IIа (тромбіну), IXa, Ха, ХIа та ХIIа. Гепарин зв'язується антитромбіном III та викликає конформаційні зміни у його молекулі.