Мінеральні добрива провокують вимивання з ґрунту кальцію, магнію, цинку, міді, марганцю і т.д., це впливає на процеси фотосинтезу, знижує стійкість рослин до захворювань. Застосування мінеральних добрив веде до ущільнення ґрунту, зниження його пористості, зменшення частки зернистих агрегатів.